تشخیص سریع موتاسیون در ژن عامل مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش allele specific pcr

Authors

نوید مسببی

navid mosabebi msc in microbiology, faculty of basic sciences, qom branch, islamic azad university, qom, iranعلوم پزشکی مازندران مریم صدرنیا

maryam sadrnia assistant professor, department of biology, payame noor university, tehran, iranتهران: تهران: دانشگاه پیام نور، گروه زیست شناسی، کد پستی 4697-19395 محمد رضا ذوالفقاری

mohammad reza zolfaghari assistant professor, department of microbiology, faculty of basic sciences, qom branch, islamic azad university , qom, iranعلوم پزشکی مازندران

abstract

سابقه و هدف: تشخیص مولکولی مقاومت در آنتی بیوتیک های موثر روی سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در این مطالعه طراحی روشی جهت تشخیص سریع موتاسیون های مرتبط به مقاومت در ژن عامل مقاومت به آنتی بیوتیک ریفابوتین مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: 40 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شامل 12 سویه مقاوم به ریفابوتین و28سویه حساس به این آنتی بیوتیک مورد استفاده قرار گرفتند که نمونه ها از بانک میکروبی مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان دانشگاه علوم پزشکی اراک اخذ شد. پرایمرهای اختصاصی با کمک نرم افزارهای blast، idt و mega طراحی و تصحیح شدند. پرایمرهای طراحی شده جهت واکنش allele specific pcr از ´3 قابلیت اتصال به نوکلئوتیدهای موتانت در کدون های 516-526-531 ژن rpob را داشته و قابلیت شناسایی حالت موتانت را داشتند، لذا عدم تشکیل باند در محصول pcr به معنی مقاوم بودن سویه به ریفابوتین بود. قطعه مورد نظر در تعدادی از نمونه ها تعیین ترادف شده و با نتایج به دست آمده مقایسه گردید. یافته ها: از 12 سویه مقاوم به ریفابوتین مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با کمک روش allele specific pcr مورد مطالعه،10 سویه به عنوان سویه های موتانت در یکی از 3کدون اصلی تشخیص داده شدند. سویه های حساس نیز فاقد موتاسیون در این کدون ها بودند. حساسیت روش معادل80 درصد با 95% ci:0.55-0.95 و ویژگی آن معادل 100 درصد با 95% ci:0/87-1 محاسبه گردید. نتایج تعیین ترادف (سکوئنس) مؤید نتایج به دست آمده بود. استنتاج: نتایج مطالعه حاضر نشان می دهد که allele specific pcr روشی ساده و سریع برای تشخیص سریع مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بوده و جهت استفاده روتین پیشنهاد می شود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تشخیص سریع موتاسیون در ژن عامل مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش Allele Specific PCR

Background and purpose: Molecular detection of antibiotic resistance in clinical strains of M.tuberculosis is of great importance. In this study, we developed a method for rapid detection of mutations resistant to the rifabutin antibiotic resistant gene. Material and methods: In this study 40 clinical isolates of M.tuberculosis including 12 resistant and 28 susceptible isolates to rifabutin we...

full text

تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع Allele Specific PCR ‏در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

  مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد.   مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، ‏ DNA ‏های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ‏حساس و مقاوم ‏به افلوکساسین موجود در بانک DNA مرکز ...

full text

تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع allele specific pcr ‏در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد.   مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، ‏ dna ‏های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ‏حساس و مقاوم ‏به افلوکساسین موجود در بانک dna مرکز تح...

full text

تعیین مقاومت به آمیکاسین در سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس MDR به روش: PCR-RFLP

  زمینه و هدف : آمیکاسین یکی از داروهای کلیدی خط 2 برای درمان سل می­باشد. جهش در کدون­های 1400، 1401 و 1483 از ژن srRNA 16 با مقاومت به آمیکاسین در ارتباط است. هدف از این مطالعه آشکارسازی این جهش­ها با استفاده از روش PCR-RFLP درسوش­های مقاوم به چند دارو ( MDR Multiple Drug Resistant ) مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به آمیکاسین بود.   روش­کار : آزمون ارزیابی حساسیت دارویی با استفاده از روش تناسب...

full text

تشخیص سریع موتاسیون در کدون 43 ژن rpsL مرتبط با مقاومت به استرپتومایسین توسط تکنیک RFLP با آنزیم‌های اندونوکلئازی BsajI و MbooII در سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

زمینه: استرپتومایسین یکی از مهم‌ترین داروهای مؤثر جهت درمان بیماری سل می‌باشد که مقاومت به آن به طور فزاینده‌ای گزارش می‌شود. شایع‌ترین موتاسیون‌های مرتبط با مقاومت به داروی استرپتومایسین در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در کدون‌های 43 و 88 &zwjژن rpsL (NC_000962.3) اتفاق می‌افتد. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات ژن rpsL در سویه‌های کلینیکی این باکتری با استفاده از دو آنزیم BsajI و MbooII است. مواد و...

full text

بررسی موتاسیون های ژن rpoB مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران شهر تهران

سابقه و هدف: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس باکتری عامل بیماری سل است که سالانه حدود 2 میلیون نفر بر اثر ابتلا به این بیماری جان خود را از دست می دهند. وجود باکتری های مقاوم به دارو های ضد سلی از عوامل مهم مرگ افراد مبتلا به سل است. از جمله مهم ترین این داروها، داروی ریفامپیسین است که به نظر می رسد مکانیسم عملکرد این دارو، دخالت در فرایند رونویسی از طریق اتصال به زیرواحد β آنزیم RNA پلیمر از می باشد....

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران

جلد ۲۴، شماره ۱۱۹، صفحات ۴۰-۴۷

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023